氣相色譜柱維護的主要目標是如何獲得
石英毛細管氣相色譜柱的性能和長壽命，而不是簡單地遵循預定的維護時間表中的維護項目。這取決于選擇合適的色譜柱、正確地安裝/系統設置，避免導致柱性能下降(斷裂、熱損壞、氧化損壞、化學損壞以及污染)的主要因素。
石英毛細管氣相色譜柱能下降的原因：
柱斷裂：氣相色譜柱的維護只要存在極小的劃痕或者聚酰亞胺保護層被破損，熔融石英柱就會斷裂。柱箱的連續加熱及冷卻，柱箱風扇導致的振動，以及纏繞在圓形柱架上都會對柱管施加應力。在這些應力的持續作用下，裂縫將會出現，直到發生斷裂。注意：大口徑的色譜柱(內徑為0.45-0.53mm)更易于斷裂。
避免斷裂不要讓色譜柱接觸尖銳的邊角。比如：柱架和標簽、GC柱箱的金屬邊緣、柱切割器實驗臺上的其他物品，以避免劃痕和破損。
避免太緊地纏繞或彎曲色譜柱。恢復若一根斷裂的色譜柱已經被加熱，很可能就破壞了固定相。丟棄斷裂的一段色譜柱(無載氣通過的一段)，從柱端切割掉6英寸，再進行安裝。若斷裂的柱子未被加熱，采用小體積接頭將兩段色譜柱連接起來。
對于一根柱子，連接頭不能超過2-3個。超過色譜柱高溫度極限將加速固定相和管表面的降解。這將會導致過早的柱流失、活性化合物的峰拖尾和/或柱效下降(分離度下降)。預防不要超過的柱溫上限。--等溫上限：柱子能夠無限期承受的溫度。
